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對草魚危害較大的，除病毒性出血病、肝膽綜合征外，還有草魚爛鰓病，尤其是對養殖的苗種和二齡小草魚，常表現為多病齊發，在應激狀態下極易引起死亡。草魚爛鰓病的癥狀多表現在鰓上，但因為發病原因、時間、病灶的不同，具體發病部位、鰓絲顏色也有不同。

車輪蟲寄生在魚的腮部及其體表部位，刺激魚體分泌大量粘液。尤其是魚苗，嚴重時可觀察到魚體表面覆蓋一層白色（易誤判為白頭白嘴病），病魚苗失去攝食能力，狂躁不安，魚體消瘦，死亡率高。對于二齡以上草魚，不會直接引起魚的死亡，但是寄生蟲的侵入，會破壞鰓部組織，引起爛鰓，甚至引發寄生性細菌感染，出現連續死魚現象。一年四季均可發病，以4-7月為高峰期。

車輪蟲屬于原生單細胞動物，普通的有機磷、擬除蟲菊酯類、抗生素類殺蟲藥物對其殺滅作用不明顯或無效果。常用0.7ppm硫酸銅、硫酸亞鐵（5:2）合劑全池噴灑，有較好的療效。可配合含苦參堿的準用藥物治療。外用時專用藥物配合0.5ppm硫酸銅，注意補充氧氣。

指環蟲大量寄生時，魚鰓部粘液分泌增多，全部或部分呈蒼白色，腮部腫脹，鰓蓋張開，游動遲緩。常與車輪蟲病起發。

指環蟲為多細胞卵生，用一般的殺蟲藥物可將蟲體殺死。當指環蟲與車輪蟲病齊發時，應先殺指環蟲，再殺車輪蟲。

中華鳋主要寄生在草魚腮上，病魚煩躁不安，腮部粘液分泌增多，，腮絲末端發炎發白。打開魚鰓，大量寄生時可肉眼觀察到像蛆一樣的小白蟲掛在鰓上。普通的殺蟲藥物均可殺滅中華鳋，多用阿維菌素或伊維菌素全水面潑灑。

常見病原為魚害粘球菌。發病時，病魚離群，行動緩慢，頭部發黑。鰓蓋下肉眼可見鰓部粘液多，鰓絲腐爛，帶有污物，鰓絲末端腐爛成“掃帚”樣，鰓蓋骨內表面充血，中間部分腐蝕成一個圓形或不規則形的透明小窗，俗稱“開天窗”。

一般采用內服加外服相結合的方法治療。內服氟苯尼考5天，外用漂白粉、二氧化氯、聚維酮碘等潑灑。

由鰓霉屬真菌引起，可見鰓小片充血、出血或失血，小部分可見鰓絲壞死。此病多發生在有機質高的池塘，特別是通過漚草培肥的魚苗塘，易引起鰓霉的生長。不用漚肥法，用飼料喂魚，常加注清水，調節水質，保持水質清爽。治療時用抗菌藥物，如杜仲葉提取物，其中含有的綠原酸和杜仲黃酮有廣譜抑菌作用，提高機體抗病力。

以上幾種爛鰓病，外表癥狀基本沒有區別，體表發黑，尤其是頭部，鰓部腫脹或失血，鰓絲腐爛，軟骨外露。通常要借助顯微鏡才能準確鑒別。

寄生蟲性爛鰓與細菌性爛鰓病常并發，甚至還與草魚的赤皮、腸炎等疾病一起發生。治療時一般采用治霉菌、殺蟲、殺菌、調水的順序治療。在治療期間，要控制投餌量，不要施肥或者捕撈，可以適量添加龍昌膽汁酸，增強草魚的免疫力和抗病力，防止魚類產生應激，避免爆發性死亡。

近年來，濫用藥物的現象越來越嚴重，魚病越來越難治，治療時應該對魚病認真分析，對癥下藥，即治好了魚病，又節約了成本，同時也防止了魚藥對水體的污染，對水質的破壞。

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